Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf541Q0GGX2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms