Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp11Q02853 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms