Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms