Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gjb2Q00977 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb2Q00977 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms