Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr2cP97760 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2cP97760 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms