Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmsP97355 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmsP97355 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmsP97355 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmsP97355 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SmsP97355 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmsP97355 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmsP97355 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms