Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1bP70700 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms