Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctps1P70698 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctps1P70698 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms