Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms