Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gabrb3P63080 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms