Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacng7P62956 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacng7P62956 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacng7P62956 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacng7P62956 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacng7P62956 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacng7P62956 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacng7P62956 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacng7P62956 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacng7P62956 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacng7P62956 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacng7P62956 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacng7P62956 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms