Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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