Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms