Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Paxbp1P58501 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms