Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Strn4P58404 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strn4P58404 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Strn4P58404 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strn4P58404 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms