Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms