Protein–RNA interactions for Protein: P50428

Arsa, Arylsulfatase A, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsaP50428 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ArsaP50428 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ArsaP50428 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ArsaP50428 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ArsaP50428 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms