Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab20P35295 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab20P35295 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab20P35295 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms