Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab17P35292 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab17P35292 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms