Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa2P31245 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms