Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msr1P30204 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms