Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp1P29452 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms