Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp3P28862 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms