Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apex1P28352 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms