Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb3P28231 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms