Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChgaP26339 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChgaP26339 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms