Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TP20293 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TP20293 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TP20293 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TP20293 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TP20293 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TP20293 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TP20293 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TP20293 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TP20293 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TP20293 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TP20293 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms