Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ntf3P20181 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ntf3P20181 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ntf3P20181 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ntf3P20181 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ntf3P20181 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ntf3P20181 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ntf3P20181 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ntf3P20181 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ntf3P20181 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf3P20181 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf3P20181 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms