Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Csn1s1P19228 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csn1s1P19228 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms