Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18528 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P18528 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P18528 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P18528 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms