Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP11369 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP11369 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP11369 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP11369 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP11369 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP11369 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP11369 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP11369 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP11369 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP11369 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP11369 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP11369 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP11369 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP11369 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP11369 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PolP11369 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PolP11369 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PolP11369 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP11369 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolP11369 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolP11369 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolP11369 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolP11369 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolP11369 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolP11369 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolP11369 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms