Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeflP08551 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeflP08551 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeflP08551 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeflP08551 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeflP08551 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeflP08551 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeflP08551 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeflP08551 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeflP08551 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeflP08551 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeflP08551 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeflP08551 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeflP08551 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeflP08551 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeflP08551 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeflP08551 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeflP08551 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeflP08551 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeflP08551 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeflP08551 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeflP08551 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeflP08551 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeflP08551 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeflP08551 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeflP08551 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeflP08551 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeflP08551 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeflP08551 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeflP08551 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeflP08551 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeflP08551 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeflP08551 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeflP08551 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeflP08551 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NeflP08551 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeflP08551 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeflP08551 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms