Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa4P06728 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa4P06728 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms