Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nptx2O70340 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nptx2O70340 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms