Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms