Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NlkO54949 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NlkO54949 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NlkO54949 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NlkO54949 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NlkO54949 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NlkO54949 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NlkO54949 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NlkO54949 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NlkO54949 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NlkO54949 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NlkO54949 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NlkO54949 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NlkO54949 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NlkO54949 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NlkO54949 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NlkO54949 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NlkO54949 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NlkO54949 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NlkO54949 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms