Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stag2O35638 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag2O35638 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag2O35638 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms