Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms