Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC117090L7N257 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC117090L7N257 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms