Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm21887J3QQ04 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms