Protein–RNA interactions for Protein: G3X992

Msl3l2, MSL3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3l2G3X992 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msl3l2G3X992 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms