Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm8005F6YKY3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8005F6YKY3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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