Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms