Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc6F2Z461 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herc6F2Z461 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms