Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Zfp558E9Q1J0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Zfp558E9Q1J0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Zfp558E9Q1J0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Zfp558E9Q1J0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Zfp558E9Q1J0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Zfp558E9Q1J0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Zfp558E9Q1J0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Zfp558E9Q1J0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Zfp558E9Q1J0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Zfp558E9Q1J0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp558E9Q1J0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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