Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gcom1E9PZ54 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gcom1E9PZ54 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms