Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r177E9PXM3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r177E9PXM3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r177E9PXM3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r177E9PXM3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r177E9PXM3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms