Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rsf1E9PWW9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsf1E9PWW9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsf1E9PWW9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms