Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rd3lB2RV38 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rd3lB2RV38 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rd3lB2RV38 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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