Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud4B2RRE7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms